Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
CUX2O14529 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CUX2O14529 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CUX2O14529 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CUX2O14529 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
CUX2O14529 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CUX2O14529 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CUX2O14529 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CUX2O14529 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CUX2O14529 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CUX2O14529 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CUX2O14529 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CUX2O14529 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CUX2O14529 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CUX2O14529 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CUX2O14529 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CUX2O14529 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CUX2O14529 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CUX2O14529 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CUX2O14529 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CUX2O14529 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CUX2O14529 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CUX2O14529 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CUX2O14529 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CUX2O14529 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CUX2O14529 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CUX2O14529 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CUX2O14529 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CUX2O14529 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CUX2O14529 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CUX2O14529 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CUX2O14529 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CUX2O14529 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CUX2O14529 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CUX2O14529 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CUX2O14529 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CUX2O14529 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CUX2O14529 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CUX2O14529 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CUX2O14529 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CUX2O14529 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CUX2O14529 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CUX2O14529 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CUX2O14529 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CUX2O14529 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CUX2O14529 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CUX2O14529 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CUX2O14529 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CUX2O14529 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CUX2O14529 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CUX2O14529 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CUX2O14529 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CUX2O14529 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CUX2O14529 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CUX2O14529 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CUX2O14529 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CUX2O14529 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CUX2O14529 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CUX2O14529 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CUX2O14529 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CUX2O14529 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CUX2O14529 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CUX2O14529 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CUX2O14529 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CUX2O14529 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CUX2O14529 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CUX2O14529 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CUX2O14529 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CUX2O14529 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CUX2O14529 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CUX2O14529 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CUX2O14529 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CUX2O14529 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CUX2O14529 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CUX2O14529 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CUX2O14529 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CUX2O14529 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CUX2O14529 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CUX2O14529 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CUX2O14529 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CUX2O14529 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CUX2O14529 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CUX2O14529 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CUX2O14529 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CUX2O14529 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CUX2O14529 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CUX2O14529 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CUX2O14529 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CUX2O14529 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CUX2O14529 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms