Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms