Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BQV1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BQV1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BQV1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BQV1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BQV1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BQV1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BQV1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BQV1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BQV1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BQV1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BQV1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BQV1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BQV1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BQV1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BQV1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BQV1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BQV1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BQV1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BQV1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BQV1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BQV1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BQV1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BQV1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BQV1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BQV1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BQV1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BQV1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BQV1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BQV1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BQV1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BQV1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BQV1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
H3BQV1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
H3BQV1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
H3BQV1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms