Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L12C9JPN9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.2 ms