Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERVV-1B6SEH8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms