Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms