Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDR42E2A6NKP2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDR42E2A6NKP2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDR42E2A6NKP2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms