Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC160A6NGH7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC160A6NGH7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms