Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM3A6NDB9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms