Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA3AA6NCI4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms