Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM72A0PK05 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM72A0PK05 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms