Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A0U1RQF3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQF3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms