Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A0A087WSZ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms