Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 BPIFB9P-201ENST00000246222 1178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 BX571846.1-201ENST00000447347 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC00877-202ENST00000464271 552 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZNF7-209ENST00000529819 513 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SMUG1-AS1-201ENST00000634796 1734 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC01532-202ENST00000591143 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ACTG1P10-201ENST00000428275 1082 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC112492.3-201ENST00000457557 1031 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CHRDL2-201ENST00000263671 1712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AL590683.1-201ENST00000439059 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RABL2A-207ENST00000409875 2282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LIPG-205ENST00000580036 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MRGPRX1-201ENST00000302797 1190 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HLA-DQB1-203ENST00000399082 1219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SGCZ-202ENST00000421524 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 NUDT9P1-201ENST00000477230 745 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC004702.1-201ENST00000580225 195 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms