Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC27P30260 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC27P30260 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC27P30260 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms