Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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