Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC004585.2-201ENST00000624090 1473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC113340.1-201ENST00000475257 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC091893.1-201ENST00000503772 399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AP000911.1-204ENST00000533091 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 DLG2-AS1_2.1-201ENST00000614607 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RNA5SP469-201ENST00000364165 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC01044-201ENST00000413637 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC009237.11-201ENST00000425635 265 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MXRA7-206ENST00000589082 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ANXA13-202ENST00000419625 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 C10orf71-AS1-201ENST00000437677 753 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 KRTAP13-1-201ENST00000355459 749 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL121761.1-203ENST00000426012 677 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC007923.4-201ENST00000578650 568 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 IKBKE-202ENST00000579827 678 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC02348-201ENST00000618724 489 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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