Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TP53TG3F-201ENST00000617705 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ITGAL-203ENST00000433423 1416 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FANCM-208ENST00000556036 2354 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC067863.2-201ENST00000559120 1980 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC016831.5-201ENST00000605249 1998 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FRMD1-201ENST00000283309 3067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 HSD3B2-201ENST00000369416 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 SIRPB1-204ENST00000381603 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZPLD1-204ENST00000491959 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TYRO3-202ENST00000559066 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 MEF2D-202ENST00000360595 3194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL356234.1-201ENST00000404534 1779 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PDZRN3-203ENST00000462146 2927 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC068669.1-201ENST00000623793 2228 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TBX19-201ENST00000367821 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL031686.1-201ENST00000472805 3876 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PWP1-201ENST00000412830 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AP001469.3-202ENST00000430259 2014 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC093525.6-201ENST00000563449 2001 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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LSAMPQ13449 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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LSAMPQ13449 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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LSAMPQ13449 KBTBD3-205ENST00000531837 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 IFT81-209ENST00000552912 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PTPRR-201ENST00000283228 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 TRAF3IP2-208ENST00000392556 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 UBA3-203ENST00000415609 2004 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PLXDC1-206ENST00000444911 2082 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 GLB1L3-203ENST00000431683 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LSAMPQ13449 AL162591.1-201ENST00000424435 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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