Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CDK20-203ENST00000375871 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TPRX1-203ENST00000543508 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PMEL-201ENST00000449260 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ALDH7A1-224ENST00000636743 2332 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC113391.1-201ENST00000507236 578 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms