Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms