Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
E2F1Q01094 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms