Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 WFDC2-201ENST00000217425 356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC00877-202ENST00000464271 552 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 IGHV3-60-201ENST00000521678 354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PAGE4-202ENST00000376141 487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MIR2110-201ENST00000459421 75 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ADGRG5-207ENST00000615867 762 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC106774.3-201ENST00000505444 169 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ODF3-203ENST00000525282 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC007032.1-201ENST00000609281 847 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PRKN-210ENST00000612540 603 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 C5orf60-208ENST00000625191 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms