Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms