Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AGAP13P-201ENST00000417888 363 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AP001453.2-201ENST00000544553 391 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RABL2A-207ENST00000409875 2282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 GPM6B-203ENST00000356942 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TRBV22-1-201ENST00000424543 337 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MRO-205ENST00000436348 1125 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RN7SL43P-201ENST00000463926 291 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AL589843.2-202ENST00000602289 740 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PADI6-201ENST00000619609 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 PAGE4-202ENST00000376141 487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 OR13C2-201ENST00000542196 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CACNA1SQ13698 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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