Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ZNF423-207ENST00000567169 4017 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NAB1-201ENST00000337386 4358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MEI1-201ENST00000401548 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 COL5A2-203ENST00000618828 6399 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TMEM239-201ENST00000361033 3892 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC026469.1-201ENST00000621095 3306 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ITGA11-201ENST00000315757 3955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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