Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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