Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL513478.3-201ENST00000641038 1095 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 KLK8-201ENST00000291726 853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL663070.1-201ENST00000438210 725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC023509.4-201ENST00000602306 775 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC091941.1-201ENST00000623003 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PRSS2-206ENST00000633969 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZNF772-209ENST00000615214 1506 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AK4P5-201ENST00000404520 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P19-201ENST00000405292 370 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC003101.1-201ENST00000412403 459 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC010267.1-201ENST00000508636 553 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SAP30L-AS1-202ENST00000519727 396 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC133548.2-202ENST00000562267 148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 FAU-206ENST00000529259 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC137932.2-201ENST00000562995 1205 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC090236.1-201ENST00000590318 768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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