Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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TMEM225BP0DP42 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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