Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SMIM3Q9BZL3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SMIM3Q9BZL3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SMIM3Q9BZL3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SMIM3Q9BZL3 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SMIM3Q9BZL3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SLC12A3-201ENST00000262502 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CDH5-201ENST00000341529 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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