Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL449266.1-201ENST00000357393 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 PAEP-202ENST00000371766 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 PLP2-201ENST00000376322 620 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 PLP2-202ENST00000376327 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 INSL6-201ENST00000381641 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CST13P-203ENST00000413633 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 WISP1-204ENST00000517423 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RRN3-206ENST00000564131 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC011472.2-201ENST00000586356 655 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC005580.1-201ENST00000592311 583 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 SSX3-204ENST00000612497 1030 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC106872.1-201ENST00000512492 1360 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 OGFRP1-201ENST00000332965 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 DEFA1-202ENST00000382692 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RPL15P3-201ENST00000391491 615 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL365366.1-201ENST00000414898 853 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 RPL3P7-201ENST00000417878 1212 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL355001.1-201ENST00000422148 444 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 LINC02521-201ENST00000440848 834 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC013489.2-201ENST00000558732 276 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC127496.2-201ENST00000576859 368 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ELOVL3-201ENST00000370005 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC097638.1-201ENST00000413663 515 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL355802.1-201ENST00000417591 990 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL031663.2-201ENST00000417630 355 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 LINC01682-201ENST00000435973 385 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL663070.1-201ENST00000438210 725 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AP000842.1-201ENST00000524467 698 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 IL18-202ENST00000524595 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC006111.1-201ENST00000573982 329 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AP000892.2-201ENST00000613535 324 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM208BQ5VWN6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms