Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC27P30260 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms