Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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