Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms