Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAMTA1Q9Y6Y1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms