Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN6Q9Y6Q1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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