Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP3Q9Y6F1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms