Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms