Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms