Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms