Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX11Q9Y5W9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms