Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP16Q9Y5T5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
USP16Q9Y5T5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms