Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNPO3Q9Y5L0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNPO3Q9Y5L0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms