Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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TRAF6Q9Y4K3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF6Q9Y4K3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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