Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms