Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO2Q9Y3B8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms