Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL11Q9Y3B7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL11Q9Y3B7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms