Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRELID3BQ9Y3B1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms