Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FARSAQ9Y285 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FARSAQ9Y285 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms