Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM50BQ9Y247 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM50BQ9Y247 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM50BQ9Y247 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms