Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR6

ZFR2, Zinc finger RNA-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFR2Q9UPR6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFR2Q9UPR6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFR2Q9UPR6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFR2Q9UPR6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms